涉密文件资料的立卷、归档工作，主要是按照档案法及其配套的法律法规和档案主管部门的要求办理。涉密文件资料在立卷、归档或者向档案馆移交时，应当对其密级和保密期限重新鉴定。属于本机关本单位产生的密件，凡是可以解密、降密或变更保密期限的，应当按照保密法规规定的程序进行解密、降密和变更保密期限，再移交档案馆馆藏。不属于本机关本单位产生的密件，原产生机关单位未作出解密、降密和变更保密期限决定的，不得擅自变更密级和保密期限。已经立卷、归档的密件，保密期限届满的，应当及时解密。
需要立卷、归档的密件，在立卷、归档时经鉴定仍然属于国家秘密的，应当在档案卷宗封面或者首页上做出与卷内密件密级和保密期限相同的标志。卷内有多份密件的，卷宗封面或者首页按最高密级和最长保密期限做出标志。
非档案管理人员查阅涉密档案，应当办理批准手续，并严格控制接触范围。关于馆藏涉密档案的密级及保密期限的变更和解密以及如何控制使用范围的问题，应按国家保密局和国家档案局制定下发的《各级国家档案馆馆藏档案解密和划分控制使用范围的暂行规定》办理。
